MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	GGT	2	6	31335	31340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655744
502	NC_021738	AGA	2	6	31391	31396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655744
503	NC_021738	GTG	2	6	31461	31466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655744
504	NC_021738	ATTA	2	8	31511	31518	50 %	50 %	0 %	0 %	525655744
505	NC_021738	CGG	2	6	31552	31557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655744
506	NC_021738	AGC	3	9	31589	31597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655744
507	NC_021738	GTG	2	6	31659	31664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655744
508	NC_021738	AGA	2	6	31775	31780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655744
509	NC_021738	CAG	2	6	31834	31839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655744
510	NC_021738	GCA	2	6	31842	31847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655744
511	NC_021738	TTA	2	6	31878	31883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655744
512	NC_021738	GAA	2	6	31923	31928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655744
513	NC_021738	AAG	2	6	32059	32064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655744
514	NC_021738	A	6	6	32193	32198	100 %	0 %	0 %	0 %	525655744
515	NC_021738	GTG	2	6	32241	32246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655744
516	NC_021738	A	6	6	32268	32273	100 %	0 %	0 %	0 %	525655744
517	NC_021738	A	6	6	32313	32318	100 %	0 %	0 %	0 %	525655744
518	NC_021738	GT	3	6	32443	32448	0 %	50 %	50 %	0 %	525655744
519	NC_021738	ACC	2	6	32527	32532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655744
520	NC_021738	TCG	2	6	32597	32602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655744
521	NC_021738	CAG	2	6	32861	32866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655745
522	NC_021738	TTG	2	6	32915	32920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655745
523	NC_021738	GGT	2	6	32938	32943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655745
524	NC_021738	ATT	2	6	32979	32984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655745
525	NC_021738	GAA	2	6	33004	33009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655745
526	NC_021738	GATT	2	8	33054	33061	25 %	50 %	25 %	0 %	525655745
527	NC_021738	GTT	2	6	33091	33096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655745
528	NC_021738	AGT	2	6	33147	33152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655745
529	NC_021738	TCGTGA	2	12	33195	33206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525655745
530	NC_021738	GCA	2	6	33247	33252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655745
531	NC_021738	TTAAA	2	10	33323	33332	60 %	40 %	0 %	0 %	525655745
532	NC_021738	A	6	6	33343	33348	100 %	0 %	0 %	0 %	525655745
533	NC_021738	TTA	2	6	33353	33358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655745
534	NC_021738	GTG	2	6	33362	33367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655745
535	NC_021738	TAT	2	6	33369	33374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655745
536	NC_021738	TA	3	6	33395	33400	50 %	50 %	0 %	0 %	525655745
537	NC_021738	GAAGTG	2	12	33415	33426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525655745
538	NC_021738	CTG	2	6	33452	33457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655745
539	NC_021738	TGT	2	6	33468	33473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655745
540	NC_021738	CAAA	2	8	33486	33493	75 %	0 %	0 %	25 %	525655745
541	NC_021738	A	6	6	33499	33504	100 %	0 %	0 %	0 %	525655745
542	NC_021738	ATG	2	6	33605	33610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655745
543	NC_021738	AATT	2	8	33647	33654	50 %	50 %	0 %	0 %	525655745
544	NC_021738	CA	3	6	33731	33736	50 %	0 %	0 %	50 %	525655745
545	NC_021738	GCA	2	6	33805	33810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655745
546	NC_021738	AAG	2	6	33920	33925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655745
547	NC_021738	GCT	2	6	33958	33963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655745
548	NC_021738	GGT	2	6	34042	34047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655745
549	NC_021738	TTG	2	6	34052	34057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655745
550	NC_021738	TGG	2	6	34065	34070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655745
551	NC_021738	ATT	2	6	34074	34079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655745
552	NC_021738	CATTT	2	10	34670	34679	20 %	60 %	0 %	20 %	525655746
553	NC_021738	GTTT	2	8	34715	34722	0 %	75 %	25 %	0 %	525655746
554	NC_021738	TTG	2	6	34817	34822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655746
555	NC_021738	GAA	2	6	34859	34864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655746
556	NC_021738	T	6	6	34896	34901	0 %	100 %	0 %	0 %	525655746
557	NC_021738	TA	3	6	34959	34964	50 %	50 %	0 %	0 %	525655746
558	NC_021738	AAT	2	6	34982	34987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655746
559	NC_021738	T	6	6	34998	35003	0 %	100 %	0 %	0 %	525655746
560	NC_021738	AC	3	6	35019	35024	50 %	0 %	0 %	50 %	525655746
561	NC_021738	CGTG	2	8	35254	35261	0 %	25 %	50 %	25 %	525655747
562	NC_021738	A	6	6	35272	35277	100 %	0 %	0 %	0 %	525655747
563	NC_021738	AAAT	2	8	35312	35319	75 %	25 %	0 %	0 %	525655747
564	NC_021738	GTAA	2	8	36519	36526	50 %	25 %	25 %	0 %	525655748
565	NC_021738	A	6	6	36529	36534	100 %	0 %	0 %	0 %	525655748
566	NC_021738	CTT	2	6	36542	36547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655748
567	NC_021738	AGT	2	6	36578	36583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655748
568	NC_021738	TTG	2	6	36589	36594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655748
569	NC_021738	GTACTA	2	12	36610	36621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525655748
570	NC_021738	TAA	2	6	36919	36924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655749
571	NC_021738	AAT	2	6	37043	37048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655749
572	NC_021738	CAT	2	6	37069	37074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655749
573	NC_021738	GAT	2	6	37144	37149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655749
574	NC_021738	T	6	6	37178	37183	0 %	100 %	0 %	0 %	525655749
575	NC_021738	TTC	2	6	37211	37216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655749
576	NC_021738	GA	3	6	37243	37248	50 %	0 %	50 %	0 %	525655749
577	NC_021738	ATA	2	6	37470	37475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655749
578	NC_021738	GCA	2	6	37533	37538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655749
579	NC_021738	GTT	2	6	37550	37555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655749
580	NC_021738	CTT	2	6	37609	37614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655749
581	NC_021738	TTG	2	6	37662	37667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655749
582	NC_021738	T	6	6	37688	37693	0 %	100 %	0 %	0 %	525655749
583	NC_021738	CTT	2	6	37732	37737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655749
584	NC_021738	CAA	2	6	37774	37779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655749
585	NC_021738	AAT	2	6	37805	37810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655749
586	NC_021738	G	6	6	37912	37917	0 %	0 %	100 %	0 %	525655749
587	NC_021738	TCA	3	9	37944	37952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655749
588	NC_021738	A	6	6	37956	37961	100 %	0 %	0 %	0 %	525655749
589	NC_021738	GCT	2	6	37965	37970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655749
590	NC_021738	TTGCA	2	10	37973	37982	20 %	40 %	20 %	20 %	525655749
591	NC_021738	TAAAT	2	10	38070	38079	60 %	40 %	0 %	0 %	525655749
592	NC_021738	ATAC	2	8	38174	38181	50 %	25 %	0 %	25 %	525655749
593	NC_021738	AAC	2	6	38207	38212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655749
594	NC_021738	GTC	2	6	38539	38544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655750
595	NC_021738	ACAA	2	8	38554	38561	75 %	0 %	0 %	25 %	525655750
596	NC_021738	TTG	2	6	38581	38586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655750
597	NC_021738	CGG	2	6	38638	38643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655750
598	NC_021738	TATC	2	8	38672	38679	25 %	50 %	0 %	25 %	525655750
599	NC_021738	TGA	2	6	38723	38728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655750
600	NC_021738	CGG	2	6	38738	38743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655750
601	NC_021738	ACGTGG	2	12	38759	38770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525655750
602	NC_021738	GCA	2	6	38772	38777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655750
603	NC_021738	CCG	2	6	38785	38790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655750
604	NC_021738	GTA	2	6	38832	38837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655750
605	NC_021738	ATT	2	6	38868	38873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655750
606	NC_021738	ATG	2	6	38926	38931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655750
607	NC_021738	CA	3	6	38975	38980	50 %	0 %	0 %	50 %	525655750
608	NC_021738	AAAATC	2	12	38989	39000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525655750
609	NC_021738	GTTA	2	8	39175	39182	25 %	50 %	25 %	0 %	525655750
610	NC_021738	TCA	2	6	39324	39329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655751
611	NC_021738	CAA	2	6	39423	39428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655751
612	NC_021738	ACCG	2	8	39429	39436	25 %	0 %	25 %	50 %	525655751
613	NC_021738	GGT	2	6	39458	39463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655751
614	NC_021738	GTG	2	6	39501	39506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655751
615	NC_021738	GAA	2	6	39600	39605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655751
616	NC_021738	TGA	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655751
617	NC_021738	CGCT	2	8	39831	39838	0 %	25 %	25 %	50 %	525655751
618	NC_021738	GTG	2	6	40071	40076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655752
619	NC_021738	TGA	3	9	40087	40095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
620	NC_021738	T	6	6	40157	40162	0 %	100 %	0 %	0 %	525655752
621	NC_021738	ATG	2	6	40210	40215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
622	NC_021738	ATG	2	6	40237	40242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
623	NC_021738	ATG	2	6	40273	40278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
624	NC_021738	CTG	2	6	40330	40335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655752
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626	NC_021738	GGA	2	6	40434	40439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655752
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628	NC_021738	TGA	2	6	40526	40531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
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633	NC_021738	TAT	2	6	40793	40798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655752
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757	NC_021738	CAT	2	6	48112	48117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
758	NC_021738	TAA	2	6	48135	48140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
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760	NC_021738	ACATC	2	10	48281	48290	40 %	20 %	0 %	40 %	525655758
761	NC_021738	T	7	7	48304	48310	0 %	100 %	0 %	0 %	525655758
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